El sexto y último elemento en el que «El Seminario de Jesús» se aleja más de todo el resto de la investigación contemporánea es el más significativo de todos. Una de las principales razones por las que los miembros de «El Seminario» creen que Jesús el sabio precede al Jesús apocalíptico es porque están convencidos de que el Evangelio de Tomás contiene mucha información independiente sobre el Jesús histórico que es tan fiable, si no más, que la que aparece en los Evangelios canónicos. Dicen que el